淡水螯虾演化的起源假说有许多种,较早期的说法是全世界淡水螯虾的祖先是从海生的海螯虾类所演化来的,其外形与淡水螯虾相当类似,淡水螯虾为海螯虾类从海中迁徙到陆域的河川中,逐渐演化调节淡水环境的生物,进而扩散到世界各处,也因此在世界各地的淡水螯虾不论外观与构造都相当类似的原因。
但是后来的研究中发现,淡水螯虾的生活史完全在淡水环境完成,并无降海繁殖的阶段,换句话说这些淡水螯虾并没有办法跨越海水的屏障,进而扩散到其它的淡水域中生活。因此推翻了早期螯虾的演化推测。
后来新的假说修正为以温带地区为中心,向世界各处扩散,但扩散的同时也有一些种类的海螯虾分别在世界各处的近海域朝向淡水水域中发展,并独立演化出不同的螯虾种类。也因此才会出现澳大利亚产的螯虾通常体型会比较具大且具有武士的姿态,而在北美洞窟中所采集到的螯虾则会缺乏色素与眼睛,且手脚细长等形态上如此巨大的差异。而这些姿态的多样化,则是从世界各地特有的螯虾分别进化出来的特征。
到了现今,先前的许多假说都因没有证据支持,且有许多不合理之处而被推翻掉。后来有学者发现了淡水螯虾的化石,证明了淡水螯虾的起源假说。淡水蝥虾的共同祖先源自二叠纪,当时地球只有一块超级大陆(Pangaea)。到了三叠纪,超级大陆分裂为两块
大陆,较北方的是劳瑞西亚(Laurasia)大陆,较南方的是冈地瓦那(Gondwana)大陆。淡水螯虾被分到了两个大陆上,基本上螯虾的栖息环境并不可能藉由海流的搬运来迁移进行演化,于是隔离演化出现今北半球的螯虾总科(Astacoidea)以及南半球的拟螯虾总科(Parastacoidea)。可以支持的证据有许多,例如淡水整虾的卵都是由母虾抱蛋后在腹部直接发育,且孵化后的外形与成熟的淡水螯虾差异便不大,而世界上所有的淡水螯虾在胚胎发育的模式皆是一样的,可以由此左证世界中所有的螯虾都应该是从同一个祖先所演化出来的。而近年来发展的DNA分子亲缘技术,更进一步证明所有的螯虾都来自同一共同祖先。
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